两个独立核算的企业可以共用一张发票吗？

来自新疆

我们建筑公司和建材公司是关联企业，有时采购一些材料两家都需要，但采购当时只开了一张以建材公司为抬头的发票，我们这以前的会计就把发票摆在建材公司的帐里（当然只入建材公司用的那部份金额），同时把建筑公司的那部份材料金额以一张内部划转单划拨过去，这样做有问题吗？我觉得两个独立的公司发票应该分开开，如不能分开开，只能先入建材公司，再由建材公司开票销售给建筑公司，至少理论上应该是这样对吗？请高手指点哦