这样的情况做账应该注意些什么？请高手赐教!

雨苇

李某挂靠A市A公司，到B市以A公司项目部的名义承建安居房，第二年A公司出现经营状况，以致营业执照不能年检，导致项目部的账户无法正常使用，李某遂在B市成立B公司，说通当地政府，将工程进度款拨付到B公司（但是三方转让协议未能签订），由B公司来收取、支付工程款，（A公司目前即没有申请注销，也年检不了）请教：

第一：如果三方转让协议到工程结束的时候才签订，B公司工程进行中只能做代收代付工程款，但是费用又做在B公司，那么这B公司的帐处理应该注意些什么细节呢?现在这种情况应该告知税务部门吗？

第二：如果三方转让协议到最后都不能签订，那么这帐处理又应该注意些什么呢？工程结束后收取的政府管理费用该做在哪个帐里呢？

第三：到B公司成立时，所有的工程款收取和拨付都有B公司来完成，那项目部的帐还需要继续做吗？又应该注意些是什么细节呢？